BİYOİNFORMATİK

Ders Açıklaması

Bu ders öğrencilere biyoinformatik konseptlerini, prensiplerini ve tekniklerini tanıtacaktır. Genom ve protein bilgi arşivlerine nasıl erişileceğini, bu arşivlerle birlikte çalışmak için geliştirilmiş araçları ve bu bilgi ve araçların hangi sorulara cevap verebileceği ele alınacaktır. Ders süresince insan genom projesi ve tarihsel gelişimi, biyoinformatiğin tıptaki önemi ve rolü, yaşamın spatial ve temporal özellikleri, merkezi ve periferal dogmalar, bilgi arşivi özellikleri ve çeşitleri, World wide web, elektronik yayınlar, bilgisayar ve bilgisayar bilimi, bilgisayar programlama, biyolojik sınıflandırma ve nomenklatür, filogenetik ilişki araştırılmasında kullanılan teknikler ve araçlar, protein yapısı, protein yapı tahmini ve belirlenmesi yöntemleri, kliniksel implikasyonlar ve 3D protein yapı görüntüleme araçları ele alınacaktır.

BİYOİNFORMATİK

Değerlendirme Araçları (Aktif Dönem)

Ders çıktıları

1. 01 Identify the biological classification and nomenclature.
2. 02 Describe protein structure .
3. 03 Explain the observables and data archives
4. 04 Explain database requirements
5. 05 List the clinical implications.
6. 06 Explain how cells read the genome from DNA to protein.
7. 07 Summarize World Wide Web
8. 08 Summarize use of sequences to determine phylogenetic relationships .
9. 09 Elaborate on computers and computer science
10. 10 Elaborate on importance of bioinformatics.

Ders Müfredatı

Referans Kitaplar & Ders Materyalleri

1. 01 Arthur Lesk. Introduction to Bioinformatics. Oxford University Publications, 2014.

Ders Çıktıları

1. L01 Biyoinformatiği tanımlamak ve açıklamak. SOLO 2.5
2. L02 Biyoinformatikte kullanılan veri tabanlarını ve araçları listelemek. SOLO 3
3. L03 Bilginin çalışma alanına nasıl uygulanacağını pratik olarak çözmek ve yorumlamak. SOLO 3.33
4. L04 Bilgiyi uygulamak ve alandaki problemlerin nasıl çözüleceğini sorgulamak. SOLO 5

Program Çıktıları

1. P01 Matematik, fen bilimleri ve ilgili mühendislik disiplinine özgü konularda yeterli bilgi birikimi edinmelidir.
2. P02 Matematik, fen bilimleri ve ilgili mühendislik disiplini alanlarındaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanabilme becerisi edinmelidir.
3. P03 Karmaşık mühendislik problemlerini saptama, tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi edinmelidir.
4. P04 Karmaşık mühendislik problemlerini çözmek için uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçme ve uygulama becerisi edinmelidir.
5. P05 Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlama becerisi edinmelidir.
6. P06 Modern tasarım yöntemlerini uygulama becerisi edinmelidir.
7. P07 Mühendislik uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirme, seçme ve kullanma becerisi edinmelidir.
8. P08 Bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanma becerisi edinmelidir.
9. P09 Karmaşık problemlerin veya disipline özgü araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlama becerisi edinmelidir.
10. P10 Karmaşık problemlerin veya disipline özgü araştırma konularının incelenmesi için deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi edinmelidir.
11. P11 Disiplin içi takımlarda çalışma becerisi edinmelidir.
12. P12 Disiplinler arası takımlarda çalışma becerisi edinmelidir.
13. P13 Bireysel çalışma becerisi edinmelidir.
14. P14 Sözlü ve yazılı etkin iletişim kurma becerisi edinmelidir.
15. P15 En az bir yabancı dil bilgisi edinmelidir.
16. P16 Etkin rapor yazma ve yazılı raporları anlama, tasarım ve üretim raporları hazırlayabilmelidir.
17. P17 Etkin sunum yapabilme becerisi edinmelidir.
18. P18 Açık ve anlaşılır talimat verme ve alma becerisi edinmelidir.
19. P19 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği konusunda bilinç (farkındalık) edinmelidir.
20. P20 Bilgiye erişebilme becerisi edinmelidir.
21. P21 Bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleme ve kendini sürekli yenileme becerisi edinmelidir.
22. P22 Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilinci edinmelidir.
23. P23 Mühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi edinmelidir.
24. P24 İş hayatındaki proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi uygulamaları hakkında bilgi edinmelidir.
25. P25 Girişimcilik, yenilikçilik hakkında farkındalık kazanmalıdır.
26. P26 Sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi edinmelidir.
27. P27 Mühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın mühendislik alanına yansıyan sorunları hakkında bilgi edinmelidir.
28. P28 Mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçları konusunda farkındalık kazanılmalıdır.

Pç-Dç Matrisi