BİYOENFORMATİK
- Ders
- MBGE305 - BİYOENFORMATİK
- Bölüm
- Moleküler Biyoloji ve Genetik - İngilizce - Lisans
- Ders Tipi
- Ders
- Durum
- Zorunlu
- Dil
- İngilizce
- Kredi
- 3
- AKTS
- 5
- T+P+L
- 2 + 0 + 2
- Ders Koordinatörleri
- Yrd. Doç. Dr. Nurten AŞİNA AMCA
- Ön Koşul
- -
- Anahtar Sözcükler
Ders Açıklaması
BIOINFORMATICS
BİYOENFORMATİK
Değerlendirme Araçları (Aktif Dönem)
| Öğe | Tür | Ağırlık (%) |
|---|---|---|
| Midterm | Ara Sınav | 35 |
| Final | Final | 45 |
| Assignment | Ödev | 20 |
| Toplam | 100 | |
Ders çıktıları
- 01 Identify the biological classification and nomenclature.
- 02 Describe protein structure .
- 03 Explain the observables and data archives
- 04 Explain database requirements
- 05 List the clinical implications.
- 06 Explain how cells read the genome from DNA to protein.
- 07 Summarize World Wide Web
- 08 Summarize use of sequences to determine phylogenetic relationships .
- 09 Elaborate on computers and computer science
- 10 Elaborate on importance of bioinformatics.
Ders Müfredatı
| Hafta | Konu |
|---|---|
| Hafta 1 | Introduction to course organisation. |
| Hafta 2 | Observables and data archives |
| Hafta 3 | Observables and data archives |
| Hafta 4 | The World Wide Web |
| Hafta 5 | The World Wide Web |
| Hafta 6 | Computers and computer science |
| Hafta 7 | Review |
| Hafta 8 | MID-TERM EXAMINATIONS |
| Hafta 9 | Computers and computer science |
| Hafta 10 | Biological classification and nomenclature. Use of sequences to determine phylogenetic relationships |
| Hafta 11 | Use of sequences to determine phylogenetic relationships |
| Hafta 12 | Introduction to protein structure |
| Hafta 13 | Protein structure prediction and engineering, Clinical implications, Genomics and proteomics |
| Hafta 14 | Review |
| Hafta 15 | Final Exams. |
Referans Kitaplar & Ders Materyalleri
- 01 Arthur Lesk. Introduction to Bioinformatics. Oxford University Publications, 2014.
Ders Çıktıları
- L01 Bilgisayar algoritmalarının, R dilbilgisinin ve grafiklerin temelinin belirlenmesi SOLO 0
- L01 Biyoinformatiği tanımlamak ve açıklamak. SOLO 2.5
- L02 R'de uygulandığı şekilde ANOVA, regresyon, çok değişkenli ve Bayes yöntemleri de dahil olmak üzere istatistiksel yöntemlerin incelenmesi SOLO 0
- L02 Biyoinformatikte kullanılan veri tabanlarını ve araçları listelemek. SOLO 3
- L03 Genomik, popülasyon genetiği, transkriptomik ve ekolojik veri analizi araçlarını, özel fonksiyonlar ve/veya R/Bioconductor'daki özel paketleri kullanarak yorumlanması SOLO 0
- L03 Bilginin çalışma alanına nasıl uygulanacağını pratik olarak çözmek ve yorumlamak. SOLO 3.33
- L04 Bilgiyi uygulamak ve alandaki problemlerin nasıl çözüleceğini sorgulamak. SOLO 3.66
Program Çıktıları
- P01 PÇ1: Moleküler biyoloji ve genetik alanında teorik ve uygulamalı bilgilerin yanı sıra güncel ve en ileri laboratuvar tekniklerini ve analiz yöntemlerini belirlemek ve kullanmak.
- P02 PO2: Moleküler biyoloji ve genetiğe ilişkin sorunları belirlemek.
- P03 PO3: Hipoteze dayalı bilimsel araştırmalar yoluyla deneyler tasarlamak, yürütmek; ve moleküler biyoloji ve genetikle ilgili sorunlara çözüm bulmak için verileri analiz etmek ve yorumlamak.
- P04 PÇ4: Hem bağımsız olarak, hem de çok disiplinli bir ekip ortamında araştırma grubunun bir parçası olarak çalışmak
- P05 PÇ5: Bilimsel araştırma etiği ve akademik dürüstlük ilkelerini uygulamak
- P06 PÇ6: Temel bilimsel literatürü ve yeni bulguları sözlü, yazılı ve görsel sunum formatlarında yorumlamak, açıklamak ve sunmak
- P07 PÇ7: Deneysel verileri ve teorik bulguları eleştirel ve analitik düşünme tekniklerini kullanarak değerlendirmek.
- P08 PÇ8: Bilimsel dergilerde yayınlanmak üzere araştırma önerileri ve makaleler hazırlamak için mevcut kabul edilebilir yöntemleri kullanmak.
- P09 PÇ9: Toplumsal sorunlara/sıkıntılara çözüm üretme/bulmada moleküler biyoloji ve genetiğin ilkelerini uygulamak.
- P10 PÇ10: Çevre ve laboratuvar güvenliği prosedürlerini belirlemek ve uygulamak.
- P11 PÇ11: Akademi, endüstriyel, tıbbi veya klinik araştırma, bilim eğitimi, bilimsel yazı ve iletişim, sağlık hizmetleri, sağlık politikası ve kamu hizmetlerinde bağımsız ve rekabetçi kariyerleri içeren proje ve işlerde gerekli mesleki becerileri belirlemek ve uygulamak.
Pç-Dç Matrisi
| ÖÇ | P01 | P02 | P03 | P04 | P05 | P06 | P07 | P08 | P09 | P10 | P11 | Ortalama |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| L01 | 1 | 4 | 0 | 3 | 3 | 0 | 3 | 0 | 4 | 0 | 4 | 2 |
| L01 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| L02 | 1 | 3 | 3 | 2 | 3 | 3 | 4 | 2 | 4 | 0 | 3 | 2.55 |
| L02 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| L03 | 1 | 3 | 1 | 3 | 3 | 4 | 3 | 2 | 4 | 0 | 4 | 2.55 |
| L03 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
| L04 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |