BİLGİSAYARLARIN TIPTAKİ UYGULAMALARI
- Ders
- MDCN001 - BİLGİSAYARLARIN TIPTAKİ UYGULAMALARI
- Bölüm
- Tıp Fakültesi
- Ders Tipi
- Ders
- Durum
- Zorunlu
- Dil
- İngilizce
- Kredi
- 0
- AKTS
- 2
- T+P+L
- 2 + 0 + 0
- Ders Koordinatörleri
- -
- Ön Koşul
- -
- Anahtar Sözcükler
Ders Açıklaması
Bu ders ile proteinlerin görüntülenmesini, canlandırılmasını, düzenlenmesini ve yayın kalitesinde görselleştirilmesini sağlayan bazı popüler moleküler grafik sistemlerinin tanıtılması amaçlanmıştır. Dersin odak noktasında yer alan sınıf içi uygulamalı eğitimler sayesinde öğrencilerin proteinlerin üç boyutlu moleküler yapılarını ve proteinlerin hem birbirleriyle hem de substratlar ve ilaçlar gibi ligandlarla olan etkileşimlerini görsel olarak inceleme konusunda sağlam beceriler geliştirmesi hedeflenmektedir. Ders ayrıca protein dizisi ve yapısı hizalama programlarının proteinler arasındaki evrimsel ilişkileri ortaya çıkarmadaki önemini de irdeleyecektir. Son olarak, amino asit değişimlerinin protein yapısı ve işlevi üzerindeki etkilerini tahmin etmenin yanı sıra mutasyonları zararlı veya iyi huylu olarak sınıflandırmak için hesaplamalı araçların nasıl kullanılacağı üzerinde durulacaktır.
BİLGİSAYARLARIN TIPTAKİ UYGULAMALARI
Değerlendirme Araçları (Aktif Dönem)
Değerlendirme öğesi tanımlanmamış.
Ders çıktıları
Henüz ders çıktısı tanımlanmamış.
Ders Müfredatı
| Hafta | Konu |
|---|---|
| Hafta 1 | General applications of computers in medical fields |
| Hafta 2 | Introduction to protein and structure -function relationship |
| Hafta 3 | Protein data bank (PDB) and protein visualization using online and offline tools |
| Hafta 4 | Molecular visualization |
| Hafta 5 | Protein-ligand interactions |
| Hafta 6 | Introduction to sequence analysis |
| Hafta 7 | Mid-term |
| Hafta 8 | Mid-term |
| Hafta 9 | Sequence alignment |
| Hafta 10 | Evolutionary relationships in proteins |
| Hafta 11 | Mutations and protein function |
| Hafta 12 | Computational prediction tools-using online tools to analyze mutation |
| Hafta 13 | Analysis of real clinical mutation examples |
| Hafta 14 | Preparing publication-quality Images |
| Hafta 15 | Final exam |
Referans Kitaplar & Ders Materyalleri
- 01 The Machinery of Life by David S. Goodsell
- 02 Introduction to Protein Structure by Branden, C., & Tooze, J.
- 03 Introduction to Bioinformatics- Arthur M. Lesk
Ders Çıktıları
Öğrenme çıktısı tanımlanmamış.
Program Çıktıları
Program çıktısı tanımlanmamış.
Pç-Dç Matrisi
PÇ-ÖÇ matrisi henüz doldurulmamış.